Ingénieur en Biologie médicale - Département de Génétique /F
Paris | emploi.fhf.fr |
Descriptif
Présentation :
La filière FAVA-Multi, labélisée depuis 2015, est une Filière de Santé Maladies Rares dédiée aux maladies vasculaires rares avec atteinte multi systémique. Elle a pour vocation d'animer et de coordonner les actions entre les acteurs impliqués dans leur prise en charge (centres de références et compétence, laboratoires de diagnostic, laboratoires de recherche et associations de patients).
Présentation brèves des différents laboratoires de la filière :
• Le département de génétique de l'hôpital Bichat réalise environ 7000 examens par an. Les pathologies traitées sont nombreuses en particulier en génétique constitutionnelle. Le secteur syndrome de Marfan et pathologies apparentées, labellisé « laboratoire de biologie médicale de référence (LBMR) » représente 1/3 de l'activité totale du laboratoire et travaille en lien avec le centre de référence national et les centres de compétences répartis sur le territoire national.
• Laboratoire HEGP : L'activité se décline autour de 4 thématiques principales Syndrome d'Ehlers-Danlos vasculaire et autres collagénopathies, maladies artérielles disséquantes, Pseudoxanthome élastique et calcifications artérielles. L'activité est en lien avec le Centre de référence coordonnateur des maladies vasculaires rares (CRMVR).
• L'unité d'Onco-angiogénétique et Génomique des tumeurs solides (Responsable Pr. Florence Coulet) appartenant au Département de génétique médicale de l'hôpital Pitié-Salpêtrière a trois thématiques majeures : Oncogénétique constitutionnelle, Oncogénétique Somatique (Génétique des tumeurs) et Maladies vasculaires héréditaires. Dans le cadre de ces dernières, elle réalise le diagnostic de la maladie de Rendu-Osler et du syndrome de malformation capillaire et malformation arterioveineuse (Filière de santé FAVA-MULTI). C'est dans ce secteur de l'angiogénétique que s'inscrit la demande de poste, secteur pour lequel le laboratoire est labellisé « laboratoire de biologie médicale de référence (LBMR).
• L'Unité d'Oncogénétique et de Maladies Multifactorielles (Pr. Calender), est intégrée au sein du service de génétique du Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Lyon, sous la responsabilité du Pr. Sanlaville. Parmi les thématique du laboratoire, le diagnostic de la maladie de Rendu-Osler occupe une place significative et représente une activité historique menée en étroite collaboration avec le Centre de Référence des Maladies Rares dédié à cette pathologie. Le laboratoire réalise également le diagnostic du syndrome malformation capillaire et malformation artérioveineuse.
Composition de l'équipe:
1 Chef de Service (PU-PH), 1 MCU-PH, 5 PH, 1 PHU, 1 AHU, 2 internes, 1 ingénieur en biologie médicale, 1 ingénieur en bio-informatique, 22 Techniciens de laboratoire, 3.5 Secrétaires médicales, 1 agent de laboratoire, 1 agent de logistique.
Quotité de temps de travail :
Du Lundi au Vendredi, 7h30 variables à l'intérieur d'une plage horaire comprise entre 8h00 et 17h30 (par roulement, en fonction des besoins du service). Repos hebdomadaire fixe le samedi et le dimanche, fermeture les jours fériés 15j de RTT repartis sur l'année pas de gardes ni astreintes
Horaire de travail : plage horaire 8H00-17h30
Vos missions :
1/ L'ingénieur en Biologie sera responsable du développement et de l'optimisation du RNA-Seq ciblé pour les pathologies de la filière FAVA-multi.
Il pourra être amené également à contribuer à l'élaboration d'autres tests fonctionnels en lien avec les pathologies de la filière qui sont :
• Syndrome de Marfan, pathologies de l'aorte ascendante et pathologies apparentées
• Syndrome d'Ehlers-Danlos vasculaire et maladies des artères de moyen calibre
• Maladie de Rendu-Osler-Weber
• Syndrome de malformation capillaire et malformation arterioveineuse
2/ Encadrement et participation à l'élaboration des dossiers de validation de méthodes
Mise en place des procédures.
3/ Veille scientifique et technique.
Recherche et développement de nouvelles technologies. Evaluation d'appareils, expertise de réactifs
4/ Conseil, formation et transfert de compétences aux différentes équipes techniques.
5/ Participation au développement et à l'amélioration des pipelines informatiques en collaboration avec les ingénieurs bio-informaticiens en lien avec les projets confiés.
6/ Publication et interventions lors de congrès scientifiques et journée de la filière FAVA-multi
Compétences recherchées
Connaissances particulières requises :
Connaissance des techniques de base de biologie moléculaire (extraction, PCR, séquençage, ). Connaissance de l'outil informatique et intérêt pour l'apprentissage des utilisations spécifiques à la génétique moléculaire : bureautique (Word, Excel), logiciels de modélisation d'amorces, d'analyse de séquences.
Connaissance du milieu des analyses de biologies médicales (particulièrement de génétique), de l'assurance qualité.
Qualités requises :
Assiduité, sens de la rigueur, dynamisme, sens de l'organisation, capacité à gérer son temps et gérer les priorités, esprit d'initiative, intérêt scientifique et technique, sens des responsabilités, autonomie, capacité à travailler en équipe et à rendre compte, communication, esprit critique par rapport aux résultats, respect du secret professionnel et de la réglementation et des règles de bonnes pratiques en génétique constitutionnelle à des fins médicales.
Présentation :
La filière FAVA-Multi, labélisée depuis 2015, est une Filière de Santé Maladies Rares dédiée aux maladies vasculaires rares avec atteinte multi systémique. Elle a pour vocation d'animer et de coordonner les actions entre les acteurs impliqués dans leur prise en charge (centres de références et compétence, laboratoires de diagnostic, laboratoires de recherche et associations de patients).
Présentation brèves des différents laboratoires de la filière :
• Le département de génétique de l'hôpital Bichat réalise environ 7000 examens par an. Les pathologies traitées sont nombreuses en particulier en génétique constitutionnelle. Le secteur syndrome de Marfan et pathologies apparentées, labellisé « laboratoire de biologie médicale de référence (LBMR) » représente 1/3 de l'activité totale du laboratoire et travaille en lien avec le centre de référence national et les centres de compétences répartis sur le territoire national.
• Laboratoire HEGP : L'activité se décline autour de 4 thématiques principales Syndrome d'Ehlers-Danlos vasculaire et autres collagénopathies, maladies artérielles disséquantes, Pseudoxanthome élastique et calcifications artérielles. L'activité est en lien avec le Centre de référence coordonnateur des maladies vasculaires rares (CRMVR).
• L'unité d'Onco-angiogénétique et Génomique des tumeurs solides (Responsable Pr. Florence Coulet) appartenant au Département de génétique médicale de l'hôpital Pitié-Salpêtrière a trois thématiques majeures : Oncogénétique constitutionnelle, Oncogénétique Somatique (Génétique des tumeurs) et Maladies vasculaires héréditaires. Dans le cadre de ces dernières, elle réalise le diagnostic de la maladie de Rendu-Osler et du syndrome de malformation capillaire et malformation arterioveineuse (Filière de santé FAVA-MULTI). C'est dans ce secteur de l'angiogénétique que s'inscrit la demande de poste, secteur pour lequel le laboratoire est labellisé « laboratoire de biologie médicale de référence (LBMR).
• L'Unité d'Oncogénétique et de Maladies Multifactorielles (Pr. Calender), est intégrée au sein du service de génétique du Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Lyon, sous la responsabilité du Pr. Sanlaville. Parmi les thématique du laboratoire, le diagnostic de la maladie de Rendu-Osler occupe une place significative et représente une activité historique menée en étroite collaboration avec le Centre de Référence des Maladies Rares dédié à cette pathologie. Le laboratoire réalise également le diagnostic du syndrome malformation capillaire et malformation artérioveineuse.
Composition de l'équipe:
1 Chef de Service (PU-PH), 1 MCU-PH, 5 PH, 1 PHU, 1 AHU, 2 internes, 1 ingénieur en biologie médicale, 1 ingénieur en bio-informatique, 22 Techniciens de laboratoire, 3.5 Secrétaires médicales, 1 agent de laboratoire, 1 agent de logistique.
Quotité de temps de travail :
Du Lundi au Vendredi, 7h30 variables à l'intérieur d'une plage horaire comprise entre 8h00 et 17h30 (par roulement, en fonction des besoins du service). Repos hebdomadaire fixe le samedi et le dimanche, fermeture les jours fériés 15j de RTT repartis sur l'année pas de gardes ni astreintes
Horaire de travail : plage horaire 8H00-17h30
Vos missions :
1/ L'ingénieur en Biologie sera responsable du développement et de l'optimisation du RNA-Seq ciblé pour les pathologies de la filière FAVA-multi.
Il pourra être amené également à contribuer à l'élaboration d'autres tests fonctionnels en lien avec les pathologies de la filière qui sont :
• Syndrome de Marfan, pathologies de l'aorte ascendante et pathologies apparentées
• Syndrome d'Ehlers-Danlos vasculaire et maladies des artères de moyen calibre
• Maladie de Rendu-Osler-Weber
• Syndrome de malformation capillaire et malformation arterioveineuse
2/ Encadrement et participation à l'élaboration des dossiers de validation de méthodes
Mise en place des procédures.
3/ Veille scientifique et technique.
Recherche et développement de nouvelles technologies. Evaluation d'appareils, expertise de réactifs
4/ Conseil, formation et transfert de compétences aux différentes équipes techniques.
5/ Participation au développement et à l'amélioration des pipelines informatiques en collaboration avec les ingénieurs bio-informaticiens en lien avec les projets confiés.
6/ Publication et interventions lors de congrès scientifiques et journée de la filière FAVA-multi
Compétences recherchées
Connaissances particulières requises :
Connaissance des techniques de base de biologie moléculaire (extraction, PCR, séquençage, ). Connaissance de l'outil informatique et intérêt pour l'apprentissage des utilisations spécifiques à la génétique moléculaire : bureautique (Word, Excel), logiciels de modélisation d'amorces, d'analyse de séquences.
Connaissance du milieu des analyses de biologies médicales (particulièrement de génétique), de l'assurance qualité.
Qualités requises :
Assiduité, sens de la rigueur, dynamisme, sens de l'organisation, capacité à gérer son temps et gérer les priorités, esprit d'initiative, intérêt scientifique et technique, sens des responsabilités, autonomie, capacité à travailler en équipe et à rendre compte, communication, esprit critique par rapport aux résultats, respect du secret professionnel et de la réglementation et des règles de bonnes pratiques en génétique constitutionnelle à des fins médicales.
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